というわけで以前作ったソースをちょろっと変更してできたのはこんな感じ。
使い方
色を変更したいMCをライブラリで選択し（複数OK)、コマンドを実行。
それぞれ値を入力するダイアログがでるので値を入力すればOK。
※内部にテキストフィールドが1個だけあるようなシンボルの変更を想定してますのでそれ以外はどうなるかわかりません。。。

◆フォントサイズ変更

var doc = fl.getDocumentDOM();
var num = prompt("フォントサイズを入力", "18");

var items = doc.library.getSelectedItems();
for (var i = 0; i < items.length; i++) {
	doc.library.editItem(items[i].name);
	doc.selectAll();
	doc.setElementTextAttr('size',num);
	doc.exitEditMode();
}

◆フォント変更

var doc = fl.getDocumentDOM();
var fontName =  prompt("フォントを指定", "A-OTF 新ゴ Pro L");

var items = doc.library.getSelectedItems();
for (var i = 0; i < items.length; i++) {
	doc.library.editItem(items[i].name);
	doc.selectAll();
	doc.setElementTextAttr('face',fontName);
	doc.exitEditMode();
}

※ここで引っかかったのはフォントの指定。
フォント名を指定するときに、flashのヒストリパネルに表示されるjsflをそのまま使ったらフォントが反映されない。
たとえば、新ゴProのLを指定したいときには、
jsflには、setElementTextAttr(‘face’,'ShinGoPro-Light’);と表示されたのでそのままコピペしたら動作しない。
フォント名を取得するサンプルで取得したフォント名を使用すると上手くいった。
setElementTextAttr(‘face’,'A-OTF 新ゴ Pro L’);ってな感じになります。
この差異の原因はFlashが日本語版か英語版かってことなのかな、まぁよくわからん。

おまけ
色と、フォントと、サイズをいっぺんに変更できるやつ

◆いろいろいっぺんに変更

var doc = fl.getDocumentDOM();
var num = prompt("フォントサイズを入力", "18");
var fontName =  prompt("フォントを指定", "A-OTF 新ゴ Pro L");
var color = prompt("テキストの文字色を入力", "#000000");
var items = doc.library.getSelectedItems();
for (var i = 0; i < items.length; i++) {
	doc.library.editItem(items[i].name);
	doc.selectAll();
	//サイズ変更
	doc.setElementTextAttr('size',num);
	//フォント変更
	doc.setElementTextAttr('face',fontName);
	//色変更
	doc.setFillColor(color);
	doc.exitEditMode();
}

一応、一式ダウンロードはこちら。

そしてできたのはこんなかんじ。
使い方
色を変更したいMCをライブラリで選択し（複数OK)、コマンドを実行。
色を入力するダイアログがでるので色値を入力すればOK。
※MCだけじゃなくて、グラフィックとかボタンでもOK。
※静止テキストだけじゃなくて、シェイプの色も変わります。

var doc = fl.getDocumentDOM();
var items = doc.library.getSelectedItems();
ret = prompt("テキストの文字色を入力", "#000000");
//alert(ret);
for (var i = 0; i < items.length; i++) {
  doc.library.editItem(items[i].name);
  doc.selectAll();
  doc.setFillColor(ret);
  doc.exitEditMode();
}

当初はステージに配置してあるオブジェクトを選択して選択されたMCの中の色を変更しようとしてたのだけど、どうも上手くいかない。
でも良く考えたらこの動作ってライブラリ内のオブジェクトを変更するのと同じことだからこれでいいや、と。

欲しい人いるかはわからんけど一応zipでおいておこう。
シンボル内のオブジェクトの色変更する.jsfl

まずはヒストリパネルから、必要な手順を選んでjsfl化しようと思ったのですが・・・
フレームの移動の部分をjsfl化してくれないので無理ということに。
※ヒストリパネルからコマンド作成は、↓の記事が参考になりました。
Mattari Blog：jsflのすすめ

じゃあ、足りない部分は自分でjsfl書いてみる！ということでjsfl初チャレンジ！！

で、できたのがこちら。

// 赤になる
// This command was recorded by Adobe Flash CS4.

//タイムラインを変数で保持
var path = fl.getDocumentDOM().getTimeline();

// インスタンスの濃淡: '#ff0000', 100%
fl.getDocumentDOM().setInstanceTint('#ff0000', 100);

//フレーム数を取得
var fr4 = path.currentFrame-4;

//指定したフレームをキーフレームに変換
path.convertToKeyframes(fr4);

//指定したフレーム数をモーショントゥイーンに変換
path.createMotionTween(fr4);

// 黒になる
// This command was recorded by Adobe Flash CS4.

var path = fl.getDocumentDOM().getTimeline();

// インスタンスプロパティ: colorMode, none
fl.getDocumentDOM().setElementProperty('colorMode', 'none');

//フレーム数を取得
var fr4 = path.currentFrame-4;

//指定したフレームをキーフレームに変換
path.convertToKeyframes(fr4);

//指定したフレーム数をモーショントゥイーンに変換
path.createMotionTween(fr4);

使い方としては、トゥイーンを終了させたい位置にキーフレームを打って、上記のコマンドを実行すると、
それぞれ4個前のフレームから始まるモーショントゥイーンが設定されます。

本当は、最初のキーフレームを打つ部分もjsflにまとめたかったのだけど、その処理を入れると色のプロパティを変更する処理が実行されなかったのよね・・・
なんかできそうな気はするけど、こんどえらい人に聞いてみよう。